蛋白質結構 | 水果好營養
蛋白質結構是指蛋白質分子的空間結構。作為一類重要的生物大分子,蛋白質主要由碳、氫、氧、氮、硫等化學元素組成。所有蛋白質都是由20種不同的L型α胺基酸連接形成的多聚體,在形成蛋白質後,這些胺基酸又被稱為殘基。蛋白質和多肽之間的界限並不是很清晰,有人基於發揮功能性作用的結構域所需的殘基數認為,若殘基數少於40,就稱之為多肽或肽。要發揮生物學功能,蛋白質需要正確摺疊為一個特定構型,主要是透過大量的非共價相互作用(如氫鍵、離子鍵、范德華力和疏水作用)來實現;此外,在一些蛋白質(特別是分泌性蛋白質)摺疊中,二硫鍵也起到關鍵作用。為了從分子水平上了解蛋白質的作用機制,常常需要測定蛋白質的三維結構。由研究蛋白質結構而發展起來了結構生物學,採用了包括X射線晶體學、核磁共振以及冷凍電鏡(cryo-EM)等技術來解析蛋白質結構。
一定數量的殘基對於發揮某一生物化學功能是必要的;40-50個殘基通常是一個功能性結構域大小的下限。蛋白質大小的範圍可以從這樣一個下限一直到數千個殘基。目前估計的蛋白質的平均長度在不同的物種中有所區別,一般約為200-380個殘基,而真核生物的蛋白質平均長度比原核生物長約55%。[1]更大的蛋白質聚合體可以透過許多蛋白質亞基形成;如由數千個肌動蛋白分子聚合形成蛋白纖維。
蛋白質三維結構的三種顯示方式。圖中蛋白質為磷酸丙醣異構酶(triose phosphate isomerase)。左:顯示全部原子,並以原子類型標色(碳原子為藍綠色,氧原子為紅色,氮原子為藍色);中:只顯示主鏈構象,以二級結構類型標色(α螺旋為紫色,β摺疊為黃色);右:顯示「溶劑可及表面」,以殘基類型標色(酸性胺基酸為紅色,鹼性胺基酸為藍色,極性胺基酸為綠色,非極性胺基酸為白色)。 上面的圖片包含可點擊的連結 蛋白質結構的交互式圖像,以PCNA為演示。(PDB 1AXC) ...蛋白質結構 | 水果好營養
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